北京交通大学是教育部直属，教育部、中国铁路总公司、北京市人民政府共建的全国重点大学，是国家“211工程”、“985工程优势学科创新平台”项目建设高校和具有研究生院的全国首批博士、硕士学位授予高校。该校牵头的“2011计划”“轨道交通安全协同创新中心”是国家首批14个认定的协同创新中心之一。截至2014年7月，学校设有14个学院，有交通运输工程、信息与通信工程2个一级学科国家重点学科，产业经济学、桥梁与隧道工程2个二级学科国家重点学科。建有15个博士后科研流动站，有20个一级学科博士点。学校有中国科学院院士4名，中国工程院院士8名， “973”首席科学家3人，国家“千人计划”入选者5人，在聘“长江学者”特聘教授和讲座教授7人，国家杰出青年基金获得者7人。学校把加强科技创新作为发展的战略重点，拥有省部级及以上科研平台46个，包括1个国家重点实验室、2个国家工程实验室、1个国家工程研究中心、1个国家能源局技术研发中心、4个国家认可实验室、5个教育部重点实验室、4个教育部工程研究中心。

轨道交通安全协同创新中心、轨道交通控制与安全国家重点实验室、下一代互联网互联设备国家工程实验室、高速铁路系统试验国家工程实验室、轨道交通运行控制系统国家工程研究中心

北京交通大学深化“政产学研用”协同创新，与我省交通、物流、信息、能源等行业企业及地方政府等单位建立战略合作关系，在人才培养、科研合作等领域开展长期、广泛的合作。与镇江市政府、镇江新区管委会三方共建北京交通大学长三角研究院，大力培育和发展创新型科技企业，构建产、学、研紧密结合的科技创新平台。